was应用更新？

linux系统下was平台更新web项目

多个class文件直接替换web-inf/classes下面的class文件，使用linux命令“stopServer.sh server1”和“startServer.sh server1”命令停止再重启服务更新文件生效。
但是使用websphere控制台重启应用后只有一个class文件不生效。
请问这是什么原因啊？应该怎么解决呢？